Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2surpQ6NV83 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2surpQ6NV83 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms