Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTA4

Rragb, Ras-related GTP-binding protein B, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RragbQ6NTA4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RragbQ6NTA4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RragbQ6NTA4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms