Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
2810408A11RikQ6NSU2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms