Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ltv1Q6NSQ7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ltv1Q6NSQ7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ltv1Q6NSQ7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ltv1Q6NSQ7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ltv1Q6NSQ7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ltv1Q6NSQ7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ltv1Q6NSQ7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ltv1Q6NSQ7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ltv1Q6NSQ7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ltv1Q6NSQ7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ltv1Q6NSQ7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ltv1Q6NSQ7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ltv1Q6NSQ7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ltv1Q6NSQ7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ltv1Q6NSQ7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ltv1Q6NSQ7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ltv1Q6NSQ7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ltv1Q6NSQ7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ltv1Q6NSQ7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ltv1Q6NSQ7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ltv1Q6NSQ7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ltv1Q6NSQ7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ltv1Q6NSQ7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ltv1Q6NSQ7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ltv1Q6NSQ7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ltv1Q6NSQ7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ltv1Q6NSQ7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ltv1Q6NSQ7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ltv1Q6NSQ7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ltv1Q6NSQ7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltv1Q6NSQ7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltv1Q6NSQ7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltv1Q6NSQ7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltv1Q6NSQ7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltv1Q6NSQ7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltv1Q6NSQ7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltv1Q6NSQ7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltv1Q6NSQ7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltv1Q6NSQ7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltv1Q6NSQ7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms