Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Pdcd11Q6NS46 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pdcd11Q6NS46 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms