Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc66Q6NS45 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc66Q6NS45 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms