Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pdzrn3Q69ZS0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms