Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Fgd6Q69ZL1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Fgd6Q69ZL1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Fgd6Q69ZL1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Fgd6Q69ZL1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Fgd6Q69ZL1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Fgd6Q69ZL1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Fgd6Q69ZL1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Fgd6Q69ZL1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Fgd6Q69ZL1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Fgd6Q69ZL1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Fgd6Q69ZL1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Fgd6Q69ZL1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Fgd6Q69ZL1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Fgd6Q69ZL1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Fgd6Q69ZL1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Fgd6Q69ZL1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Fgd6Q69ZL1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Fgd6Q69ZL1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Fgd6Q69ZL1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms