Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd1cQ69ZK6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms