Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fnip1Q68FD7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fnip1Q68FD7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fnip1Q68FD7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fnip1Q68FD7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fnip1Q68FD7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms