Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY9

BC080695, cDNA sequence BC080695, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC080695Q66JY9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BC080695Q66JY9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms