Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Top2bQ64511 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Top2bQ64511 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms