Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifit1Q64282 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifit1Q64282 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifit1Q64282 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifit1Q64282 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifit1Q64282 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifit1Q64282 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifit1Q64282 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifit1Q64282 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifit1Q64282 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifit1Q64282 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifit1Q64282 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifit1Q64282 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifit1Q64282 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifit1Q64282 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifit1Q64282 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ifit1Q64282 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ifit1Q64282 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ifit1Q64282 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifit1Q64282 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms