Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6eQ64253 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms