Protein–RNA interactions for Protein: Q64096

Mcf2l, Guanine nucleotide exchange factor DBS, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcf2lQ64096 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcf2lQ64096 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcf2lQ64096 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcf2lQ64096 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcf2lQ64096 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcf2lQ64096 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcf2lQ64096 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcf2lQ64096 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcf2lQ64096 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcf2lQ64096 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcf2lQ64096 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcf2lQ64096 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcf2lQ64096 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mcf2lQ64096 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mcf2lQ64096 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms