Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms