Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha6Q62413 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms