Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TrhQ62361 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TrhQ62361 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TrhQ62361 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TrhQ62361 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TrhQ62361 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TrhQ62361 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TrhQ62361 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TrhQ62361 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TrhQ62361 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TrhQ62361 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TrhQ62361 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TrhQ62361 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TrhQ62361 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TrhQ62361 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TrhQ62361 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TrhQ62361 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrhQ62361 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms