Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sall3Q62255 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sall3Q62255 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms