Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a2Q62203 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms