Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

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Length 661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd180Q62192 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd180Q62192 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cd180Q62192 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cd180Q62192 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd180Q62192 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd180Q62192 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd180Q62192 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd180Q62192 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd180Q62192 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd180Q62192 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd180Q62192 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd180Q62192 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd180Q62192 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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