Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf1Q62187 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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