Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctr9Q62018 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms