Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Odf1Q61999 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Odf1Q61999 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Odf1Q61999 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Odf1Q61999 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Odf1Q61999 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Odf1Q61999 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Odf1Q61999 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Odf1Q61999 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf1Q61999 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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