Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Npm1Q61937 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Npm1Q61937 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Npm1Q61937 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Npm1Q61937 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Npm1Q61937 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Npm1Q61937 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Npm1Q61937 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Npm1Q61937 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Npm1Q61937 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Npm1Q61937 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Npm1Q61937 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms