Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Itga7Q61738 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms