Protein–RNA interactions for Protein: Q61626

Grik5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik5Q61626 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grik5Q61626 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grik5Q61626 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grik5Q61626 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grik5Q61626 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grik5Q61626 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Grik5Q61626 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grik5Q61626 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Grik5Q61626 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik5Q61626 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms