Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gli3Q61602 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gli3Q61602 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms