Protein–RNA interactions for Protein: Q61475

Cd55, Complement decay-accelerating factor, GPI-anchored, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55Q61475 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd55Q61475 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd55Q61475 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms