Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxf1Q61080 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms