Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TmpoQ61033 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TmpoQ61033 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TmpoQ61033 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TmpoQ61033 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TmpoQ61033 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TmpoQ61033 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TmpoQ61033 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TmpoQ61033 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TmpoQ61033 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TmpoQ61033 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TmpoQ61033 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TmpoQ61033 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TmpoQ61033 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TmpoQ61033 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TmpoQ61033 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TmpoQ61033 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TmpoQ61033 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TmpoQ61033 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TmpoQ61033 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TmpoQ61033 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TmpoQ61033 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TmpoQ61033 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TmpoQ61033 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TmpoQ61033 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TmpoQ61033 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms