Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxg1Q60987 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms