Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf3Q60980 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms