Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
JrkQ60976 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
JrkQ60976 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
JrkQ60976 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
JrkQ60976 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
JrkQ60976 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
JrkQ60976 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
JrkQ60976 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms