Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Laptm4aQ60961 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms