Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HellsQ60848 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HellsQ60848 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HellsQ60848 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HellsQ60848 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HellsQ60848 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HellsQ60848 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HellsQ60848 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HellsQ60848 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HellsQ60848 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HellsQ60848 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HellsQ60848 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HellsQ60848 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HellsQ60848 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HellsQ60848 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HellsQ60848 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HellsQ60848 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HellsQ60848 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HellsQ60848 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HellsQ60848 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms