Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnot7Q60809 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot7Q60809 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.1 ms