Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkn2dQ60773 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn2dQ60773 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms