Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CttnQ60598 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CttnQ60598 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CttnQ60598 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CttnQ60598 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CttnQ60598 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CttnQ60598 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CttnQ60598 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CttnQ60598 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CttnQ60598 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms