Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema5bQ60519 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms