Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms