Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFZ0

UPF0711 protein C18orf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XFZ0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q5XFZ0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Q5XFZ0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Q5XFZ0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q5XFZ0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Q5XFZ0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q5XFZ0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q5XFZ0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q5XFZ0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q5XFZ0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q5XFZ0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q5XFZ0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Q5XFZ0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q5XFZ0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q5XFZ0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q5XFZ0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q5XFZ0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q5XFZ0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q5XFZ0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q5XFZ0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q5XFZ0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Q5XFZ0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q5XFZ0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Q5XFZ0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q5XFZ0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Q5XFZ0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q5XFZ0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q5XFZ0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q5XFZ0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q5XFZ0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q5XFZ0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q5XFZ0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q5XFZ0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q5XFZ0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q5XFZ0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Q5XFZ0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q5XFZ0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q5XFZ0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q5XFZ0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Q5XFZ0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q5XFZ0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q5XFZ0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q5XFZ0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Q5XFZ0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Q5XFZ0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q5XFZ0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q5XFZ0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q5XFZ0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q5XFZ0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q5XFZ0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q5XFZ0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q5XFZ0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Q5XFZ0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q5XFZ0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q5XFZ0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q5XFZ0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q5XFZ0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q5XFZ0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Q5XFZ0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q5XFZ0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q5XFZ0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q5XFZ0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q5XFZ0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q5XFZ0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q5XFZ0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q5XFZ0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q5XFZ0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q5XFZ0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q5XFZ0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q5XFZ0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q5XFZ0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q5XFZ0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q5XFZ0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q5XFZ0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q5XFZ0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q5XFZ0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q5XFZ0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q5XFZ0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms