Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdcp1Q5U462 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms