Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Myh1Q5SX40 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms