Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ankrd40Q5SUE8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd40Q5SUE8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms