Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf215Q5SPX3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf215Q5SPX3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms