Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc85aQ5SP85 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms