Protein–RNA interactions for Protein: Q5M956

Kctd1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd1Q5M956 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Kctd1Q5M956 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kctd1Q5M956 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kctd1Q5M956 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kctd1Q5M956 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kctd1Q5M956 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kctd1Q5M956 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kctd1Q5M956 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kctd1Q5M956 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Kctd1Q5M956 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kctd1Q5M956 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kctd1Q5M956 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kctd1Q5M956 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kctd1Q5M956 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kctd1Q5M956 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kctd1Q5M956 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kctd1Q5M956 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kctd1Q5M956 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kctd1Q5M956 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kctd1Q5M956 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kctd1Q5M956 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kctd1Q5M956 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kctd1Q5M956 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms