Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms