Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc3Q5DU56 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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